Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Myc-207ENSMUST00000188482 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtprdQ64487 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm4889-201ENSMUST00000075321 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm43499-201ENSMUST00000202091 2107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Cfap100-202ENSMUST00000127508 417 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm11231-201ENSMUST00000117895 1706 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprdQ64487 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms