Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 2900052N01Rik-203ENSMUST00000191603 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm12364-201ENSMUST00000144419 547 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm8379-201ENSMUST00000165448 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm2907-201ENSMUST00000181256 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Sprr1a-201ENSMUST00000054599 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 E330010L02Rik-201ENSMUST00000136639 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm15749-201ENSMUST00000161848 612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm21370-201ENSMUST00000177659 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Rpl21-ps12-201ENSMUST00000080061 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Csl-201ENSMUST00000056085 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Alg13-203ENSMUST00000123710 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 1810011H11Rik-202ENSMUST00000227060 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 S100a10-201ENSMUST00000045756 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Tmbim6-205ENSMUST00000160635 871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ggta1-209ENSMUST00000164889 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 4931431B13Rik-202ENSMUST00000205646 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cux1P53564 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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