Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ighv2-5-201ENSMUST00000103449 347 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Wdr45-202ENSMUST00000115687 1299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm13450-201ENSMUST00000121107 167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm13685-201ENSMUST00000122462 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm13564-201ENSMUST00000131533 657 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm37994-201ENSMUST00000192124 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mir6378-201ENSMUST00000183357 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 AC154548.2-201ENSMUST00000224621 469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm25973-201ENSMUST00000083717 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm10113-201ENSMUST00000072437 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Hmox2-203ENSMUST00000120232 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 2900076A07Rik-207ENSMUST00000181492 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Taar3-201ENSMUST00000045152 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm4889-201ENSMUST00000075321 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cux1P53564 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms