Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ehmt1-201ENSMUST00000046227 4554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ikbkg-207ENSMUST00000114133 6994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ankmy1-201ENSMUST00000112998 3243 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tfrc-202ENSMUST00000120680 1860 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nup107-201ENSMUST00000064848 3114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms