Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Atg16l1Q8C0J2 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Dpysl2-201ENSMUST00000022629 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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