Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm17033-201ENSMUST00000146663 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Lyrm7-205ENSMUST00000144164 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Eef1g-201ENSMUST00000052248 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm4405-201ENSMUST00000106038 982 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm22609-201ENSMUST00000158286 121 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm26739-201ENSMUST00000181041 427 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ly6c1-205ENSMUST00000187347 522 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm37994-201ENSMUST00000192124 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm15635-201ENSMUST00000127834 371 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 E330010L02Rik-201ENSMUST00000136639 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm18500-201ENSMUST00000223493 820 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm23405-201ENSMUST00000082542 160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mir181c-201ENSMUST00000083549 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC100729.1-201ENSMUST00000225458 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm13178-201ENSMUST00000036876 1227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mkln1os-201ENSMUST00000139185 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ctla4-201ENSMUST00000027164 1933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms