Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Lig3-203ENSMUST00000092849 4560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm37039-201ENSMUST00000193733 2485 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tmem63c-203ENSMUST00000146292 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Smoc1-201ENSMUST00000021564 3439 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Orai2-202ENSMUST00000196454 3990 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Defa6P50704 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms