Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Top3bQ9Z321 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Top3bQ9Z321 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Top3bQ9Z321 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms