Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mbd3Q9Z2D8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms