Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lemd3Q9WU40 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lemd3Q9WU40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms