Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb3Q9R1P1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb3Q9R1P1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms