Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Lamc3Q9R0B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lamc3Q9R0B6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms