Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx4Q9QY61 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms