Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim44Q9QXA7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim44Q9QXA7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms