Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Habp4Q9JKS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Habp4Q9JKS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Habp4Q9JKS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms