Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx5Q9JKQ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irx5Q9JKQ4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms