Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EefsecQ9JHW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EefsecQ9JHW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EefsecQ9JHW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms