Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Capn12Q9ER56 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Capn12Q9ER56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms