Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rapgef4Q9EQZ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rapgef4Q9EQZ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rapgef4Q9EQZ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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