Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SyncQ9EPM5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SyncQ9EPM5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SyncQ9EPM5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms