Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700008P02RikQ9DAJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms