Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx5Q9D8U8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx5Q9D8U8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms