Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi35Q9D8C4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi35Q9D8C4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi35Q9D8C4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifi35Q9D8C4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifi35Q9D8C4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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