Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb4aQ9D6F9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms