Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed11Q9D2R4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms