Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trmt44Q9D2Q2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trmt44Q9D2Q2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms