Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Urm1Q9D2P4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Urm1Q9D2P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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