Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pbdc1Q9D0B6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pbdc1Q9D0B6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms