Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdhd3Q9CYW4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdhd3Q9CYW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms