Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed5Q9CXE7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms