Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxxc1Q9CWW7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms