Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma8Q9CWH6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma8Q9CWH6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma8Q9CWH6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms