Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
4930535I16RikQ9CUI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms