Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vta1Q9CR26 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vta1Q9CR26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms