Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl41Q9CQN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mrpl41Q9CQN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl41Q9CQN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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