Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN4

Sostdc1, Sclerostin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sostdc1Q9CQN4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sostdc1Q9CQN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sostdc1Q9CQN4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms