Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccer1Q9CQL2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms