Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmed6Q9CQG0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmed6Q9CQG0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms