Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RTRAFQ9CQE8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RTRAFQ9CQE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTRAFQ9CQE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms