Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arl4dQ99PE9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arl4dQ99PE9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arl4dQ99PE9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arl4dQ99PE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arl4dQ99PE9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms