Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170 ms