Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcgf6Q99NA9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcgf6Q99NA9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms