Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pagr1aQ99L02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pagr1aQ99L02 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pagr1aQ99L02 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms