Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Def8Q99J78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Def8Q99J78 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Def8Q99J78 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms