Protein–RNA interactions for Protein: Q921N6

Ddx27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx27Q921N6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ddx27Q921N6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddx27Q921N6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddx27Q921N6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms