Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE4

UPF0729 protein C18orf32 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WE4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q91WE4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q91WE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q91WE4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q91WE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q91WE4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q91WE4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q91WE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q91WE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q91WE4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q91WE4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q91WE4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q91WE4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q91WE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q91WE4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q91WE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms