Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Farp2Q91VS8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Farp2Q91VS8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Farp2Q91VS8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms