Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CTTNBP2Q8WZ74 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CTTNBP2Q8WZ74 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CTTNBP2Q8WZ74 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms