Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfxapQ8VCG9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfxapQ8VCG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfxapQ8VCG9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RfxapQ8VCG9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfxapQ8VCG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms