Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H7

Tcp11l2, T-complex protein 11-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11l2Q8K1H7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcp11l2Q8K1H7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcp11l2Q8K1H7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms